วันที่ 4 เมษายน 2563 นายเชิดเกียรติ อัตถากร โฆษกกระทรวงการต่างประเทศ ยืนยันกรณีมีกระแสข่าวกระทรวงการต่างประเทศ ฝ่าฝืนคำสั่งนายกรัฐมนตรี โดยออกเอกสารให้คนไทยนับร้อยคนเดินทางเข้าประเทศว่าไม่เป็นความจริง พร้อมชี้แจงว่า ผู้โดยสารที่เดินทางกลับเข้าประเทศคือกลุ่มที่อยู่ในช่วงรอยต่อ ทุกคนได้รับหนังสือรับรองและใบรับรองแพทย์ fit to fly ซึ่งมีอายุ 72 ชั่วโมง ก่อนหน้าที่จะมีการออกประกาศให้ชะลอการเดินทาง
ส่วนเรื่องกักตัวเพื่อเฝ้าระวังโรคนั้น ยืนยันว่าหลายสถานทูตออกประกาศเน้นย้ำว่า หากคนไทยคนใดกลับประเทศในช่วงนี้จะถูกกักตัวทุกกรณีเป็นเวลา 14 วันตามประกาศของรัฐบาลโดยไม่มีข้อยกเว้น